Факультет повышения квалификации является структурным подразделением КГУФКСТ и призван выполнять задачи последипломного образования и повышения квалификации специалистов отрасли.
Факультет повышения квалификации и переподготовки кадров был образован в 1984 году. Первым его деканом до 1990 года был доцент Анатолий Митрофанович Ковалевский. На факультете была заложена основа процесса повышения квалификации специалистов в области физической культуры (тренеров, методистов, учителей физической культуры, преподавателей физического воспитания).
В 1990 году деканом факультета становится профессор, кандидат биологических наук, заслуженный учитель Кубани Любовь Васильевна Ярошенко, которая возглавляла это подразделение вуза до 2007 года совместно с заместителем декана факультета, кандидатом педагогических наук Карасевой Натальей Александровной и методистами Касумовой Ольгой Александровной и Тимошкиной Юлей Николаевной. В этот период была проделана работа по созданию базы подготовки и переподготовки специалистов, желающих поменять свою профессиональную деятельность и самоопределиться в сфере физической культуры и спорта.
С 2007 года и по настоящее время факультетом руководит выпускница вуза – кандидат педагогических наук, доцент, отличник физической культуры и спорта Ольга Николаевна Костюкова, которая более 20 лет занимается учебно-методической и педагогической работой. В период модернизации системы образования коллективом факультета были разработана и адаптирована программа повышения квалификации и переподготовки кадров современным требованиям, предъявляемым к работникам сферы физической культуры и спорта.
В настоящее время ФПКПК КГУФКСТ является основным базовым учебным и научно-методическим центром дополнительного образования специалистов в сфере физической культуры, спорта и туризма в регионе, который в своей работе применяет инновационные образовательные технологии. Факультет осуществляет взаимодействие с Министерством образования, науки и молодежной политики Краснодарского края и Министерством физической культуры и спорта Краснодарского края, краевыми федерациями по видам спорта, а также федерациями России по волейболу, триатлону, прыжкам на батуте, регби, баскетболу и гандболу.
С 2020 по 2023 годы в рамках реализации федерального проекта «Спорт – норма жизни» было обучено 4349 специалистов, из них по программам профессиональной переподготовки кадров – 1920 человек, по программам повышения квалификации – 2429 человек.
На сегодняшний день факультет успешно развивается в системе дополнительного профессионального образования, оказывая услуги по профессиональной переподготовке и повышению квалификации специалистов регионов России.
Широкий спектр образовательных услуг в сфере ДПО и профессиональный подход к предлагаемым направлениям подготовки способствует популяризации факультета не только в Краснодарском крае, но и других регионах России, что, в свою очередь, приводит к увеличению числа слушателей.